Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms