Protein–RNA interactions for Protein: P47911

Rpl6, 60S ribosomal protein L6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl6P47911 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl6P47911 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl6P47911 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.5 ms