Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf4P43488 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf4P43488 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf4P43488 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf4P43488 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf4P43488 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf4P43488 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf4P43488 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf4P43488 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf4P43488 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf4P43488 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf4P43488 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf4P43488 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf4P43488 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf4P43488 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf4P43488 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf4P43488 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf4P43488 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf4P43488 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tnfsf4P43488 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tnfsf4P43488 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms