Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ItgavP43406 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ItgavP43406 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ItgavP43406 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ItgavP43406 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ItgavP43406 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ItgavP43406 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms