Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NodalP43021 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NodalP43021 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NodalP43021 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NodalP43021 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NodalP43021 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NodalP43021 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NodalP43021 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NodalP43021 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NodalP43021 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NodalP43021 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NodalP43021 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NodalP43021 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NodalP43021 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NodalP43021 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NodalP43021 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NodalP43021 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NodalP43021 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NodalP43021 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NodalP43021 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NodalP43021 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NodalP43021 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NodalP43021 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NodalP43021 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NodalP43021 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NodalP43021 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NodalP43021 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NodalP43021 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NodalP43021 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NodalP43021 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NodalP43021 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NodalP43021 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NodalP43021 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NodalP43021 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NodalP43021 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NodalP43021 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NodalP43021 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NodalP43021 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NodalP43021 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NodalP43021 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NodalP43021 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NodalP43021 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NodalP43021 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NodalP43021 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NodalP43021 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NodalP43021 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NodalP43021 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NodalP43021 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NodalP43021 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NodalP43021 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NodalP43021 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NodalP43021 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NodalP43021 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NodalP43021 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NodalP43021 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms