Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tac1P41539 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tac1P41539 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tac1P41539 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tac1P41539 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tac1P41539 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tac1P41539 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms