Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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