Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col18a1P39061 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms