Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk2P38575 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk2P38575 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk2P38575 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upk2P38575 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upk2P38575 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk2P38575 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk2P38575 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms