Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpargP37238 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpargP37238 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PpargP37238 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PpargP37238 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PpargP37238 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PpargP37238 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PpargP37238 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PpargP37238 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PpargP37238 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PpargP37238 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PpargP37238 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PpargP37238 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PpargP37238 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PpargP37238 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PpargP37238 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpargP37238 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpargP37238 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpargP37238 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpargP37238 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpargP37238 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpargP37238 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PpargP37238 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpargP37238 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpargP37238 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpargP37238 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpargP37238 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpargP37238 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpargP37238 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpargP37238 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpargP37238 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PpargP37238 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpargP37238 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpargP37238 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpargP37238 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpargP37238 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpargP37238 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpargP37238 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpargP37238 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PpargP37238 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpargP37238 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpargP37238 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpargP37238 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpargP37238 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpargP37238 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpargP37238 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpargP37238 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpargP37238 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PpargP37238 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpargP37238 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpargP37238 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpargP37238 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpargP37238 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpargP37238 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpargP37238 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpargP37238 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpargP37238 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpargP37238 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpargP37238 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpargP37238 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PpargP37238 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PpargP37238 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PpargP37238 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PpargP37238 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PpargP37238 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PpargP37238 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PpargP37238 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PpargP37238 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PpargP37238 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PpargP37238 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PpargP37238 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PpargP37238 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PpargP37238 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PpargP37238 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PpargP37238 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PpargP37238 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PpargP37238 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PpargP37238 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PpargP37238 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PpargP37238 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PpargP37238 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PpargP37238 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PpargP37238 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PpargP37238 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PpargP37238 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PpargP37238 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PpargP37238 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PpargP37238 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PpargP37238 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PpargP37238 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PpargP37238 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PpargP37238 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PpargP37238 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PpargP37238 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PpargP37238 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PpargP37238 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PpargP37238 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PpargP37238 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PpargP37238 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpargP37238 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms