Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PtprkP35822 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PtprkP35822 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprkP35822 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprkP35822 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtprkP35822 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtprkP35822 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprkP35822 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PtprkP35822 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprkP35822 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms