Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rfc1P35601 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms