Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab17P35292 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab17P35292 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab17P35292 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab17P35292 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms