Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms