Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptk2P34152 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms