Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2aP34056 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2aP34056 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2aP34056 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2aP34056 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2aP34056 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2aP34056 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2aP34056 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2aP34056 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2aP34056 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2aP34056 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2aP34056 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2aP34056 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2aP34056 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms