Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd28P31041 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd28P31041 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd28P31041 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd28P31041 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd28P31041 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd28P31041 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd28P31041 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd28P31041 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms