Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnnd1P30999 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms