Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VtnP29788 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VtnP29788 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VtnP29788 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VtnP29788 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VtnP29788 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VtnP29788 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VtnP29788 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VtnP29788 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VtnP29788 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VtnP29788 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VtnP29788 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VtnP29788 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VtnP29788 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VtnP29788 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VtnP29788 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VtnP29788 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VtnP29788 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VtnP29788 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VtnP29788 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VtnP29788 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VtnP29788 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VtnP29788 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VtnP29788 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VtnP29788 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VtnP29788 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VtnP29788 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VtnP29788 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VtnP29788 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VtnP29788 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VtnP29788 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VtnP29788 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VtnP29788 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VtnP29788 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VtnP29788 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VtnP29788 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VtnP29788 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VtnP29788 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VtnP29788 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VtnP29788 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VtnP29788 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VtnP29788 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VtnP29788 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VtnP29788 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VtnP29788 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VtnP29788 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VtnP29788 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VtnP29788 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VtnP29788 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VtnP29788 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VtnP29788 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VtnP29788 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VtnP29788 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VtnP29788 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VtnP29788 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VtnP29788 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VtnP29788 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VtnP29788 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VtnP29788 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VtnP29788 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VtnP29788 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VtnP29788 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VtnP29788 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VtnP29788 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VtnP29788 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VtnP29788 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VtnP29788 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VtnP29788 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VtnP29788 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VtnP29788 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VtnP29788 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VtnP29788 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VtnP29788 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VtnP29788 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VtnP29788 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VtnP29788 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VtnP29788 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VtnP29788 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VtnP29788 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VtnP29788 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VtnP29788 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VtnP29788 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VtnP29788 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VtnP29788 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VtnP29788 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VtnP29788 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VtnP29788 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VtnP29788 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VtnP29788 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VtnP29788 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VtnP29788 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VtnP29788 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VtnP29788 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VtnP29788 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VtnP29788 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VtnP29788 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VtnP29788 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VtnP29788 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VtnP29788 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VtnP29788 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms