Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dusp1P28563 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dusp1P28563 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dusp1P28563 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dusp1P28563 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dusp1P28563 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dusp1P28563 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dusp1P28563 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dusp1P28563 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dusp1P28563 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dusp1P28563 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dusp1P28563 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dusp1P28563 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dusp1P28563 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dusp1P28563 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dusp1P28563 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dusp1P28563 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dusp1P28563 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dusp1P28563 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dusp1P28563 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dusp1P28563 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dusp1P28563 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dusp1P28563 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dusp1P28563 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dusp1P28563 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dusp1P28563 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dusp1P28563 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms