Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apex1P28352 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apex1P28352 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apex1P28352 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apex1P28352 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apex1P28352 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apex1P28352 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms