Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv4P28322 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv4P28322 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv4P28322 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv4P28322 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv4P28322 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv4P28322 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv4P28322 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv4P28322 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv4P28322 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv4P28322 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv4P28322 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv4P28322 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms