Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms