Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CftrP26361 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CftrP26361 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CftrP26361 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CftrP26361 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CftrP26361 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CftrP26361 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CftrP26361 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CftrP26361 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CftrP26361 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CftrP26361 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CftrP26361 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CftrP26361 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CftrP26361 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CftrP26361 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CftrP26361 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CftrP26361 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CftrP26361 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CftrP26361 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CftrP26361 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CftrP26361 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CftrP26361 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CftrP26361 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CftrP26361 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CftrP26361 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CftrP26361 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CftrP26361 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CftrP26361 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CftrP26361 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CftrP26361 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CftrP26361 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CftrP26361 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CftrP26361 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CftrP26361 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CftrP26361 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CftrP26361 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CftrP26361 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CftrP26361 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CftrP26361 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CftrP26361 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CftrP26361 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CftrP26361 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CftrP26361 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CftrP26361 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CftrP26361 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CftrP26361 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CftrP26361 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CftrP26361 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CftrP26361 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CftrP26361 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CftrP26361 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CftrP26361 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CftrP26361 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CftrP26361 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CftrP26361 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CftrP26361 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CftrP26361 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CftrP26361 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CftrP26361 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CftrP26361 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CftrP26361 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CftrP26361 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CftrP26361 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CftrP26361 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CftrP26361 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CftrP26361 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CftrP26361 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CftrP26361 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CftrP26361 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CftrP26361 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CftrP26361 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CftrP26361 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CftrP26361 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CftrP26361 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CftrP26361 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CftrP26361 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CftrP26361 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CftrP26361 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CftrP26361 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CftrP26361 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CftrP26361 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CftrP26361 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CftrP26361 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CftrP26361 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CftrP26361 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CftrP26361 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CftrP26361 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CftrP26361 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CftrP26361 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CftrP26361 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CftrP26361 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CftrP26361 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CftrP26361 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CftrP26361 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CftrP26361 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CftrP26361 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CftrP26361 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CftrP26361 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CftrP26361 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CftrP26361 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms