Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd247P24161 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd247P24161 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd247P24161 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd247P24161 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd247P24161 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd247P24161 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd247P24161 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 478.7 ms