Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms