Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms