Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou3f1P21952 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou3f1P21952 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms