Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klra1P20937 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klra1P20937 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klra1P20937 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klra1P20937 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Klra1P20937 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klra1P20937 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms