Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prim1P20664 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prim1P20664 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prim1P20664 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prim1P20664 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prim1P20664 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prim1P20664 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prim1P20664 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms