Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P20040 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P20040 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P20040 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P20040 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P20040 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P20040 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P20040 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P20040 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P20040 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P20040 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P20040 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P20040 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P20040 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P20040 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P20040 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P20040 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P20040 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P20040 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P20040 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P20040 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P20040 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P20040 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P20040 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P20040 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P20040 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P20040 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P20040 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P20040 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P20040 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P20040 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P20040 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P20040 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P20040 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P20040 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P20040 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P20040 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P20040 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P20040 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P20040 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P20040 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P20040 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P20040 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P20040 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P20040 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P20040 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P20040 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P20040 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P20040 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P20040 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P20040 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P20040 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P20040 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P20040 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P20040 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P20040 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P20040 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P20040 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P20040 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P20040 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P20040 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P20040 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P20040 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P20040 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P20040 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P20040 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P20040 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P20040 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P20040 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P20040 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P20040 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P20040 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P20040 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P20040 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P20040 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P20040 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P20040 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P20040 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P20040 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P20040 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P20040 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P20040 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P20040 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P20040 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P20040 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P20040 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P20040 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P20040 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P20040 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P20040 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P20040 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P20040 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P20040 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P20040 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P20040 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P20040 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P20040 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P20040 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P20040 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P20040 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms