Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6ka1P18653 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms