Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
P18530 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
P18530 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
P18530 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
P18530 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
P18530 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
P18530 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
P18530 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
P18530 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
P18530 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
P18530 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
P18530 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
P18530 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
P18530 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
P18530 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
P18530 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
P18530 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
P18530 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
P18530 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
P18530 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P18530 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P18530 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P18530 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
P18530 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P18530 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
P18530 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P18530 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
P18530 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
P18530 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
P18530 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P18530 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P18530 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
P18530 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P18530 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P18530 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
P18530 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
P18530 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P18530 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P18530 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P18530 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
P18530 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P18530 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P18530 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
P18530 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P18530 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P18530 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P18530 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
P18530 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P18530 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P18530 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P18530 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P18530 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P18530 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
P18530 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P18530 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P18530 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P18530 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
P18530 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
P18530 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
P18530 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P18530 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P18530 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
P18530 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
P18530 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P18530 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P18530 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P18530 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P18530 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
P18530 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P18530 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
P18530 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P18530 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
P18530 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
P18530 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms