Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18528 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18528 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18528 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
P18528 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18528 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18528 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18528 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18528 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
P18528 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18528 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18528 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18528 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18528 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18528 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18528 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18528 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18528 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18528 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18528 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
P18528 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18528 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18528 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18528 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18528 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18528 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18528 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18528 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18528 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18528 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18528 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18528 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18528 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18528 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18528 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18528 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18528 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P18528 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
P18528 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18528 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18528 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18528 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18528 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18528 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18528 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18528 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18528 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18528 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18528 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18528 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18528 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18528 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18528 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18528 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18528 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18528 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18528 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18528 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
P18528 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18528 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18528 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18528 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18528 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18528 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18528 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18528 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18528 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18528 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18528 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18528 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18528 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
P18528 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18528 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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