Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms