Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sptan1P16546 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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