Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme1P15532 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme1P15532 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme1P15532 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nme1P15532 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme1P15532 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme1P15532 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme1P15532 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme1P15532 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme1P15532 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms