Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms