Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms