Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Calb1P12658 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Calb1P12658 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb1P12658 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb1P12658 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Calb1P12658 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Calb1P12658 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Calb1P12658 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Calb1P12658 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calb1P12658 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calb1P12658 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms