Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctla2aP12399 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms