Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtcP11725 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtcP11725 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtcP11725 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtcP11725 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtcP11725 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtcP11725 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtcP11725 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtcP11725 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtcP11725 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtcP11725 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtcP11725 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtcP11725 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
OtcP11725 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtcP11725 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtcP11725 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
OtcP11725 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtcP11725 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtcP11725 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtcP11725 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtcP11725 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtcP11725 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtcP11725 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtcP11725 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtcP11725 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtcP11725 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtcP11725 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtcP11725 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtcP11725 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtcP11725 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtcP11725 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtcP11725 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OtcP11725 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtcP11725 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtcP11725 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OtcP11725 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtcP11725 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtcP11725 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtcP11725 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtcP11725 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtcP11725 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtcP11725 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtcP11725 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtcP11725 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtcP11725 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtcP11725 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtcP11725 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtcP11725 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtcP11725 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtcP11725 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtcP11725 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtcP11725 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtcP11725 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtcP11725 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtcP11725 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtcP11725 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtcP11725 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtcP11725 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtcP11725 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtcP11725 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtcP11725 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtcP11725 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtcP11725 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
OtcP11725 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtcP11725 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtcP11725 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtcP11725 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtcP11725 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtcP11725 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtcP11725 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtcP11725 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtcP11725 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtcP11725 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtcP11725 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OtcP11725 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtcP11725 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtcP11725 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtcP11725 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OtcP11725 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtcP11725 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtcP11725 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtcP11725 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtcP11725 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtcP11725 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtcP11725 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtcP11725 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtcP11725 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtcP11725 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtcP11725 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtcP11725 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OtcP11725 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtcP11725 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtcP11725 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtcP11725 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtcP11725 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtcP11725 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtcP11725 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtcP11725 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtcP11725 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtcP11725 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms