Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga5P11688 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga5P11688 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga5P11688 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga5P11688 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga5P11688 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga5P11688 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms