Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolP11369 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolP11369 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolP11369 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolP11369 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolP11369 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolP11369 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolP11369 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolP11369 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolP11369 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolP11369 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolP11369 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolP11369 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolP11369 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolP11369 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolP11369 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PolP11369 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PolP11369 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PolP11369 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolP11369 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolP11369 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolP11369 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolP11369 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolP11369 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolP11369 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolP11369 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolP11369 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolP11369 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolP11369 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolP11369 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolP11369 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolP11369 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolP11369 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolP11369 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolP11369 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolP11369 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolP11369 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PolP11369 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolP11369 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolP11369 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PolP11369 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolP11369 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolP11369 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolP11369 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolP11369 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolP11369 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolP11369 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolP11369 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolP11369 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolP11369 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolP11369 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolP11369 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolP11369 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolP11369 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PolP11369 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolP11369 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolP11369 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolP11369 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolP11369 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolP11369 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolP11369 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolP11369 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PolP11369 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PolP11369 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PolP11369 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PolP11369 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PolP11369 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PolP11369 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PolP11369 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PolP11369 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PolP11369 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PolP11369 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PolP11369 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PolP11369 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PolP11369 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PolP11369 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PolP11369 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PolP11369 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PolP11369 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PolP11369 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PolP11369 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PolP11369 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PolP11369 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PolP11369 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PolP11369 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PolP11369 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PolP11369 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PolP11369 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PolP11369 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PolP11369 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PolP11369 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PolP11369 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PolP11369 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PolP11369 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PolP11369 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PolP11369 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PolP11369 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PolP11369 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PolP11369 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PolP11369 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms