Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms