Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nid1P10493 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nid1P10493 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nid1P10493 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nid1P10493 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nid1P10493 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms