Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb4P10284 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb4P10284 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb4P10284 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb4P10284 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb4P10284 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb4P10284 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxb4P10284 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb4P10284 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms