Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem254bP0DN90 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms