Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms