Protein–RNA interactions for Protein: P0C872

Jmjd7, JmjC domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd7P0C872 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms